As áreas predominantes de pesquisa da SSAEE são Saúde Coletiva e Ciências da Saúde.

As linhas de pesquisa são:

⦁ Trabalho e saúde dos trabalhadores de saúde.
⦁ Indicadores de saúde.
⦁ Análise de informações dos sistemas de informações em saúde.
⦁ Indicadores de prescrição farmacêutica.
⦁ Construção, adaptação e validação de instrumentos de medida em saúde.
⦁ Ética e bioética.