El curso académico de máster de Salud Colectiva de la UEFS se creó en 1997 y estableció las bases para la implantación del PPGSC. El curso es presencial y tiene una duración de 24 meses.
El proceso selectivo para el Máster de Salud Colectiva se lleva a cabo a través de la línea de investigación y se orienta mediante una vinculación directa con los proyectos de investigación en curso dentro del Programa. Las matrículas para la selección de candidatos serán abiertas, mediante un edicto publicado por el Pro-Rectorado de Investigación y Posgraduación, con antecedencia mínima de un mes a la apertura de las inscripciones y de dos meses a la fecha del inicio del proceso selectivo.
La selección tiene lugar en cuatro etapas: Evaluación de proyectos; Prueba de Idioma Extranjero; Prueba de Conocimientos de la Salud Colectiva; y Entrevista con Evaluación del Currículo. Las tres primeras etapas son eliminatorias y la última clasificatoria. Todo el cuerpo docente participa en algún momento del proceso de selección, alternándose los miembros de la comisión de organización, a cada año, como una forma de distribución del trabajo más equitativa, dando oportunidad a todo el cuerpo docente de conocer los procedimientos y contribuir al perfeccionamiento del proceso.